現在、ベーシック/プラス/プロ用のログイン画面( https://app.cocolog-nifty.com/t/app )では、
・ココログアカウント
・@nifty ID
のどちらでもログイン出来るようになっていますよね。
これが、6月9日以降はココログアカウントは使えない画面に変わるので
ログインの際は@nifty IDを使うよう変更(=切り替え)して下さい
という意味だと、私は理解しています。
(多分、合っていると思うのですが…)
既にログイン時に@nifty IDを使用していらっしゃるのでしたら、
6/9以降もそのままで大丈夫のはずです。