こんにちは。
>別で楽天などのASPを登録して貼り付け
特に問題ありません。
サイドバーへの貼付けは下記のFAQが参考になります。
■ブログパーツを貼るにはどうしたらいいの?
http://cocolog.kaiketsu.nifty.com/faqs/17057/thread
ブログパーツについてのFAQですが、アフィリエイトタグでも考え方は同じです。
FAQ内『6.以下のような「タグを貼るソース」を貼り付けます』のところで、
アフィリエイトサイトから発行された表示用タグを貼り付ければOKです。
試してみてください。